MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021881	TAG	2	6	303983	303988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464825
5002	NC_021881	TTA	2	6	303994	303999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464825
5003	NC_021881	T	6	6	304043	304048	0 %	100 %	0 %	0 %	526464825
5004	NC_021881	AGG	2	6	304066	304071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464825
5005	NC_021881	CTT	2	6	304585	304590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464292
5006	NC_021881	T	7	7	304599	304605	0 %	100 %	0 %	0 %	526464292
5007	NC_021881	A	6	6	304607	304612	100 %	0 %	0 %	0 %	526464292
5008	NC_021881	TAG	2	6	304618	304623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464292
5009	NC_021881	GCAA	2	8	304671	304678	50 %	0 %	25 %	25 %	526464292
5010	NC_021881	TGCA	2	8	304725	304732	25 %	25 %	25 %	25 %	526464292
5011	NC_021881	TTC	2	6	304743	304748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464292
5012	NC_021881	CATGC	2	10	304847	304856	20 %	20 %	20 %	40 %	526464292
5013	NC_021881	TG	3	6	304911	304916	0 %	50 %	50 %	0 %	526464292
5014	NC_021881	TAA	2	6	304926	304931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464292
5015	NC_021881	GC	3	6	304950	304955	0 %	0 %	50 %	50 %	526464292
5016	NC_021881	GGA	2	6	304972	304977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464292
5017	NC_021881	CTT	2	6	304986	304991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464292
5018	NC_021881	T	6	6	305226	305231	0 %	100 %	0 %	0 %	526464826
5019	NC_021881	TGA	2	6	305343	305348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464826
5020	NC_021881	A	6	6	305374	305379	100 %	0 %	0 %	0 %	526464826
5021	NC_021881	AG	3	6	305383	305388	50 %	0 %	50 %	0 %	526464826
5022	NC_021881	AGA	2	6	305707	305712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464293
5023	NC_021881	TGA	2	6	305721	305726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5024	NC_021881	AGCAG	2	10	305758	305767	40 %	0 %	40 %	20 %	526464293
5025	NC_021881	ATA	2	6	305793	305798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464293
5026	NC_021881	AGT	2	6	305875	305880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5027	NC_021881	ATAA	2	8	305885	305892	75 %	25 %	0 %	0 %	526464293
5028	NC_021881	T	6	6	305930	305935	0 %	100 %	0 %	0 %	526464293
5029	NC_021881	ATG	2	6	305940	305945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5030	NC_021881	GGA	2	6	305963	305968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464293
5031	NC_021881	AGT	2	6	306034	306039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5032	NC_021881	TTG	2	6	306087	306092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464293
5033	NC_021881	AGC	2	6	306129	306134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464293
5034	NC_021881	TGC	2	6	306145	306150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464293
5035	NC_021881	T	7	7	306159	306165	0 %	100 %	0 %	0 %	526464293
5036	NC_021881	CA	3	6	306200	306205	50 %	0 %	0 %	50 %	526464293
5037	NC_021881	ATA	2	6	306255	306260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464293
5038	NC_021881	ATT	2	6	306338	306343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464293
5039	NC_021881	GCTTTG	2	12	306374	306385	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526464293
5040	NC_021881	T	6	6	306439	306444	0 %	100 %	0 %	0 %	526464293
5041	NC_021881	AT	3	6	306576	306581	50 %	50 %	0 %	0 %	526464293
5042	NC_021881	GAT	2	6	306602	306607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5043	NC_021881	TCT	2	6	306608	306613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464293
5044	NC_021881	TTA	2	6	306702	306707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464293
5045	NC_021881	ACC	2	6	306713	306718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464293
5046	NC_021881	GTG	2	6	306726	306731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464293
5047	NC_021881	ATA	2	6	306732	306737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464293
5048	NC_021881	TGG	2	6	306804	306809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464293
5049	NC_021881	CT	3	6	306812	306817	0 %	50 %	0 %	50 %	526464293
5050	NC_021881	TTG	2	6	306831	306836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464293
5051	NC_021881	GAT	2	6	306845	306850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464293
5052	NC_021881	AAG	2	6	306851	306856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464293
5053	NC_021881	GAG	2	6	306929	306934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464293
5054	NC_021881	TAT	2	6	306935	306940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464293
5055	NC_021881	AGC	2	6	306951	306956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464293
5056	NC_021881	GC	3	6	307112	307117	0 %	0 %	50 %	50 %	526464293
5057	NC_021881	GAT	2	6	308547	308552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464294
5058	NC_021881	AGGCA	2	10	308558	308567	40 %	0 %	40 %	20 %	526464294
5059	NC_021881	TGC	2	6	308582	308587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464294
5060	NC_021881	TGC	2	6	308738	308743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464294
5061	NC_021881	TAT	2	6	308774	308779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464294
5062	NC_021881	TAA	2	6	308822	308827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464294
5063	NC_021881	AGA	2	6	308840	308845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464294
5064	NC_021881	TA	3	6	308871	308876	50 %	50 %	0 %	0 %	526464294
5065	NC_021881	GC	3	6	308924	308929	0 %	0 %	50 %	50 %	526464294
5066	NC_021881	GAG	2	6	309088	309093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464294
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5071	NC_021881	ATG	2	6	309321	309326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464294
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5073	NC_021881	GGA	2	6	309374	309379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464294
5074	NC_021881	TAG	2	6	309436	309441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464294
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5078	NC_021881	CCATT	2	10	309682	309691	20 %	40 %	0 %	40 %	526464827
5079	NC_021881	CT	3	6	309713	309718	0 %	50 %	0 %	50 %	526464827
5080	NC_021881	AATG	2	8	309727	309734	50 %	25 %	25 %	0 %	526464827
5081	NC_021881	CTTC	2	8	309751	309758	0 %	50 %	0 %	50 %	526464827
5082	NC_021881	TAT	2	6	309787	309792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464827
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5093	NC_021881	A	6	6	310467	310472	100 %	0 %	0 %	0 %	526464829
5094	NC_021881	ATCC	2	8	310936	310943	25 %	25 %	0 %	50 %	526464830
5095	NC_021881	AGG	2	6	311011	311016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464830
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5098	NC_021881	TAG	2	6	311300	311305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464830
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5105	NC_021881	AGT	2	6	311616	311621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464830
5106	NC_021881	GC	3	6	311755	311760	0 %	0 %	50 %	50 %	526464830
5107	NC_021881	CAA	2	6	311883	311888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464295
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5109	NC_021881	TTCT	2	8	311919	311926	0 %	75 %	0 %	25 %	526464295
5110	NC_021881	CTC	2	6	311932	311937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464295
5111	NC_021881	CCTA	2	8	311980	311987	25 %	25 %	0 %	50 %	526464295
5112	NC_021881	ATC	2	6	312013	312018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464295
5113	NC_021881	TGCT	2	8	312088	312095	0 %	50 %	25 %	25 %	526464295
5114	NC_021881	GCA	2	6	312140	312145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464295
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5116	NC_021881	AAT	2	6	312317	312322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464295
5117	NC_021881	GAG	2	6	312355	312360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464295
5118	NC_021881	TAG	2	6	312408	312413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464295
5119	NC_021881	TCA	2	6	312437	312442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464295
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5121	NC_021881	GGAG	2	8	312563	312570	25 %	0 %	75 %	0 %	526464295
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5123	NC_021881	CAT	2	6	312700	312705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464295
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5246	NC_021881	TGA	2	6	323399	323404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464299
5247	NC_021881	GTG	2	6	323437	323442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464299
5248	NC_021881	TAAG	2	8	323467	323474	50 %	25 %	25 %	0 %	526464299
5249	NC_021881	AGA	2	6	323521	323526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464299
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5251	NC_021881	TGC	2	6	323697	323702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464300
5252	NC_021881	GCT	2	6	323743	323748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464300
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5254	NC_021881	GAT	2	6	323884	323889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464300
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5261	NC_021881	CTG	2	6	324416	324421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464300
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5264	NC_021881	AAG	2	6	324503	324508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464300
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5272	NC_021881	CATT	2	8	324813	324820	25 %	50 %	0 %	25 %	526464300
5273	NC_021881	AG	3	6	324829	324834	50 %	0 %	50 %	0 %	526464300
5274	NC_021881	GAATG	2	10	324855	324864	40 %	20 %	40 %	0 %	526464300
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5278	NC_021881	TGT	2	6	325151	325156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464300
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5319	NC_021881	TAGTGG	2	12	327697	327708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	526464304
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5341	NC_021881	GTA	2	6	328692	328697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464304
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5347	NC_021881	CAGTG	2	10	329112	329121	20 %	20 %	40 %	20 %	526464304
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5349	NC_021881	GTTA	2	8	329189	329196	25 %	50 %	25 %	0 %	526464304
5350	NC_021881	TGT	2	6	329236	329241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464304
5351	NC_021881	TTC	2	6	329242	329247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464304
5352	NC_021881	AG	3	6	329296	329301	50 %	0 %	50 %	0 %	526464304
5353	NC_021881	TCA	2	6	329316	329321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464304
5354	NC_021881	GAT	2	6	329333	329338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464304
5355	NC_021881	TAG	2	6	329383	329388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464304
5356	NC_021881	GAG	2	6	329399	329404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464304
5357	NC_021881	A	6	6	329444	329449	100 %	0 %	0 %	0 %	526464304
5358	NC_021881	AGC	2	6	329455	329460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464304
5359	NC_021881	CTG	2	6	329469	329474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464304
5360	NC_021881	ATC	2	6	329484	329489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464304
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5362	NC_021881	GA	3	6	329523	329528	50 %	0 %	50 %	0 %	526464304
5363	NC_021881	CT	3	6	329573	329578	0 %	50 %	0 %	50 %	526464304
5364	NC_021881	GGC	2	6	329854	329859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464305
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5491	NC_021881	TGA	2	6	336930	336935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464308
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